Laboratoire Mixte International PathoBios

Le LMI PathoBios, Observatoire des Agents Phytopathogènes en Afrique de l’Ouest : biodiversité et biosécurité, formalise le partenariat de long-terme existant entre l’INERA au Burkina Faso et l’IRD en France dans le domaine de la protection des cultures.

Le LMI PathoBios est implanté sur deux sites au Burkina Faso : l’INERA Kamboinsé, à proximité de Ouagadougou et l’INERA FarakoBa, à Bobo-Dioulasso. Ces plateformes opérationnelles permettent de réaliser les principales manipulations en biologie moléculaire, microbiologie et expérimentation végétale. Outre le travail réalisé au Burkina Faso, des collaborations dynamiques (projets en commun, accueils, missions) existent avec de nombreux pays de la sous-région. Le LMI PathoBios vise à proposer des solutions aux problèmes quotidiens des agriculteurs, c’est-à-dire, dans un contexte de changement climatique et d’une augmentation de la population, limiter les dégâts dus aux bio-agresseurs dans les cultures pour assurer la sécurité alimentaire. Pour ce faire, il est nécessaire de :
  • mettre en place de la biosurveillance des cultures vivrières
  • mettre en évidence ou développer des variétés résistantes aux bio-agresseurs
  • identifier et vulgariser des pratiques culturales adaptées, incluant les méthodes biologiques (extraits de plantes, micro-organismes phytobénéfiques….)
  • proposer des méthodes efficaces pour le contrôle de la qualité sanitaire des semences.
Les chercheurs du LMI PathoBios publient des résultats de recherche novateurs, avec un objectif d’excellence scientifique notamment avec la mise au point de nouveaux outils de diagnostic, l’épidémiologie moléculaire, les biotechnologies ou encore les approches intégratives de type ‘One Health’ ou ‘Phytobiomes’.

La vocation du LMI PathoBios est de contribuer au renforcement des capacités, avec un investissement important dans formation, notamment l’encadrement d’étudiants (Master et doctorants principalement), l’organisation d’ateliers de formation et la participation à l’enseignement dans les universités du Burkina et dans la sous- région.

https://twitter.com/PathoBios
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1 to 10 of 56 Results
Jul 16, 2026
Billard, Estelle; Thomas, Emilie; Olalegbin, Abiodoun; Simonin, Julien; Tollenaere, Charlotte, 2026, "Phenotypic evaluation of Rice yellow mottle virus isolates from Burkina Faso in single and multiple infections context", https://doi.org/10.23708/EPS6SQ, DataSuds, V1, UNF:6:nib900xnc1FX77iEXeLmJw== [fileUNF]
In the aim to test the hypothesis that multiple infections, both within viral species (between viral lineages) and between the two pathogens (virus and bacteria), impact the structure of viral population and fitness proxies, we collected virus and bacteria infecting rice in Burki...
Tabular Data - 20.3 KB - 1 Variables, 360 Observations - UNF:6:OurjvCbhi14ADJtUye1jyA==
Données
Dataset for the experiment related to objective 1 _ single infections
Tabular Data - 22.4 KB - 1 Variables, 243 Observations - UNF:6:p2oiGK1RlFHy5k2gxR/2jw==
Données
Dataset for the experiment related to objective 2 _ competition between 2 RYMV isolates
Tabular Data - 56.8 KB - 1 Variables, 969 Observations - UNF:6:iuOGHah3OPHzWiRHP9LTjQ==
Données
Dataset for the experiment related to objective 3_ virus-bacteria co-infections
Tabular Data - 898 B - 1 Variables, 12 Observations - UNF:6:zCAks5x76iQZTK08nvXshw==
Documentation
Data dictionary for the experiment related to objective 1 _ single infections
Tabular Data - 836 B - 2 Variables, 13 Observations - UNF:6:I47dKFCzRquRW89HaDA9aQ==
Documentation
Data dictionary for the experiment related to objective 2 _ competition between 2 RYMV isolates
Tabular Data - 761 B - 1 Variables, 11 Observations - UNF:6:fD72DIDeNMxSIuGZ6MLqFg==
Documentation
Data dictionary for the experiment related to objective 3_ virus-bacteria co-infections
Adobe PDF - 633.2 KB - MD5: 24c43e0358a2e442f8fd89103ede6c14
Documentation
experimental methodology
Plain Text - 2.3 KB - MD5: cf58cdb3dd83c23262ab36943cf80643
Documentation
contains the citation, description and conditions of use, or even access, depending on the case, to the dataset
Mar 11, 2025
Guigma, Abdoul Kader; Saengram, Phonsiri; Bangratz, Martine; Kassankogno, Itolou Abalo; Tollenaere, Charlotte; Billard, Estelle, 2025, "Symptom evaluation, sampling, and molecular detection for two rice diseases (rice yellow mottle and Bacterial leaf streak) in western Burkina Faso (2021-2022)", https://doi.org/10.23708/QB8BOO, DataSuds, V1, UNF:6:8ljQXziWNW5W0EiHZ9s4Cg== [fileUNF]
Co-occurrence of multiple diseases and co-infection of individual plants by various pathogens have potential epidemiological and evolutionary implications. However detailed epidemiolocal assessment involving multiple diseases remain rare, especially considering pathogens from dif...
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