Laboratoire Mixte International PathoBios

Le LMI PathoBios, Observatoire des Agents Phytopathogènes en Afrique de l’Ouest : biodiversité et biosécurité, formalise le partenariat de long-terme existant entre l’INERA au Burkina Faso et l’IRD en France dans le domaine de la protection des cultures.

Le LMI PathoBios est implanté sur deux sites au Burkina Faso : l’INERA Kamboinsé, à proximité de Ouagadougou et l’INERA FarakoBa, à Bobo-Dioulasso. Ces plateformes opérationnelles permettent de réaliser les principales manipulations en biologie moléculaire, microbiologie et expérimentation végétale. Outre le travail réalisé au Burkina Faso, des collaborations dynamiques (projets en commun, accueils, missions) existent avec de nombreux pays de la sous-région. Le LMI PathoBios vise à proposer des solutions aux problèmes quotidiens des agriculteurs, c’est-à-dire, dans un contexte de changement climatique et d’une augmentation de la population, limiter les dégâts dus aux bio-agresseurs dans les cultures pour assurer la sécurité alimentaire. Pour ce faire, il est nécessaire de :
  • mettre en place de la biosurveillance des cultures vivrières
  • mettre en évidence ou développer des variétés résistantes aux bio-agresseurs
  • identifier et vulgariser des pratiques culturales adaptées, incluant les méthodes biologiques (extraits de plantes, micro-organismes phytobénéfiques….)
  • proposer des méthodes efficaces pour le contrôle de la qualité sanitaire des semences.
Les chercheurs du LMI PathoBios publient des résultats de recherche novateurs, avec un objectif d’excellence scientifique notamment avec la mise au point de nouveaux outils de diagnostic, l’épidémiologie moléculaire, les biotechnologies ou encore les approches intégratives de type ‘One Health’ ou ‘Phytobiomes’.

La vocation du LMI PathoBios est de contribuer au renforcement des capacités, avec un investissement important dans formation, notamment l’encadrement d’étudiants (Master et doctorants principalement), l’organisation d’ateliers de formation et la participation à l’enseignement dans les universités du Burkina et dans la sous- région.

https://twitter.com/PathoBios
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MS Excel Spreadsheet - 9.4 KB - MD5: 6049d9135961dd7184c529d85ea41ed6
Data
The dataset corresponds to a list of wild plant species identified in the borders of six rice fields (from three geographical zones in western Burkina Faso) during a survey performed in 2017.
Tabular Data - 1.3 MB - 30 Variables, 1013 Observations - UNF:6:8c6k9qLm161y3wkp00DBcQ==
DataGeospatial
Supplementary table 1: results obtained for 1013 isolates (CSV format)
Plain Text - 2.8 KB - MD5: 9bbe51374fb82aac0a934bb07ee832cf
Documentation
Dataset citation and description
Tabular Data - 1.3 MB - 30 Variables, 1013 Observations - UNF:6:8c6k9qLm161y3wkp00DBcQ==
DataGeospatial
Supplementary table 1: results obtained for 1013 isolates (Excel format)
Tabular Data - 1.6 KB - 2 Variables, 18 Observations - UNF:6:HJ9b5k2w16J5ne7PzDaBhA==
Documentation
Phenotypic evaluation of 4 RYMV isolates on 5 rice cultivars: data dictionary.
Tabular Data - 90.0 KB - 19 Variables, 1125 Observations - UNF:6:HEgYv4Lt8b+jR6FvJu8iwg==
Data
Phenotypic evaluation of 4 RYMV isolates on 5 rice cultivars. Notation of symptoms (symptom severity scale), intra-plant viral load (number of RYMV copies) and plant height measurements.
Tabular Data - 1.7 KB - 2 Variables, 19 Observations - UNF:6:+TzkOVPeIdsgY1RVAf+koQ==
Documentation
Phenotypic evaluation of 13 RYMV isolates on one susceptible rice cultivar: data dictionary.
Tabular Data - 60.3 KB - 20 Variables, 560 Observations - UNF:6:gBF2FdWDRDNua8FVXfgyRA==
Data
Phenotypic evaluation of 13 RYMV isolates on one susceptible rice cultivar. Notation of symptoms (symptom severity scale), intra-plant viral load (number of RYMV copies) and plant height measurements.
Adobe PDF - 516.6 KB - MD5: 239896b27d9093ce38464e206d4b0901
Documentation
Main documentation in English (4 pages, including figures, photos and references) "Methodology for phenotypic evaluation of RYMV isolates under controlled conditions"
Tabular Data - 2.4 KB - 2 Variables, 16 Observations - UNF:6:IImh9MretzuHiTJt01JxqA==
Documentation
Data dictionary of the file Data_RYMV_BF_Fields_Dataset.tab
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