Laboratoire Mixte International PathoBios

Le LMI PathoBios, Observatoire des Agents Phytopathogènes en Afrique de l’Ouest : biodiversité et biosécurité, formalise le partenariat de long-terme existant entre l’INERA au Burkina Faso et l’IRD en France dans le domaine de la protection des cultures.

Le LMI PathoBios est implanté sur deux sites au Burkina Faso : l’INERA Kamboinsé, à proximité de Ouagadougou et l’INERA FarakoBa, à Bobo-Dioulasso. Ces plateformes opérationnelles permettent de réaliser les principales manipulations en biologie moléculaire, microbiologie et expérimentation végétale. Outre le travail réalisé au Burkina Faso, des collaborations dynamiques (projets en commun, accueils, missions) existent avec de nombreux pays de la sous-région. Le LMI PathoBios vise à proposer des solutions aux problèmes quotidiens des agriculteurs, c’est-à-dire, dans un contexte de changement climatique et d’une augmentation de la population, limiter les dégâts dus aux bio-agresseurs dans les cultures pour assurer la sécurité alimentaire. Pour ce faire, il est nécessaire de :
  • mettre en place de la biosurveillance des cultures vivrières
  • mettre en évidence ou développer des variétés résistantes aux bio-agresseurs
  • identifier et vulgariser des pratiques culturales adaptées, incluant les méthodes biologiques (extraits de plantes, micro-organismes phytobénéfiques….)
  • proposer des méthodes efficaces pour le contrôle de la qualité sanitaire des semences.
Les chercheurs du LMI PathoBios publient des résultats de recherche novateurs, avec un objectif d’excellence scientifique notamment avec la mise au point de nouveaux outils de diagnostic, l’épidémiologie moléculaire, les biotechnologies ou encore les approches intégratives de type ‘One Health’ ou ‘Phytobiomes’.

La vocation du LMI PathoBios est de contribuer au renforcement des capacités, avec un investissement important dans formation, notamment l’encadrement d’étudiants (Master et doctorants principalement), l’organisation d’ateliers de formation et la participation à l’enseignement dans les universités du Burkina et dans la sous- région.

https://twitter.com/PathoBios
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21 to 30 of 47 Results
Tabular Data - 1.7 KB - 2 Variables, 19 Observations - UNF:6:+TzkOVPeIdsgY1RVAf+koQ==
Documentation
Phenotypic evaluation of 13 RYMV isolates on one susceptible rice cultivar: data dictionary.
Tabular Data - 60.3 KB - 20 Variables, 560 Observations - UNF:6:gBF2FdWDRDNua8FVXfgyRA==
Data
Phenotypic evaluation of 13 RYMV isolates on one susceptible rice cultivar. Notation of symptoms (symptom severity scale), intra-plant viral load (number of RYMV copies) and plant height measurements.
Adobe PDF - 516.6 KB - MD5: 239896b27d9093ce38464e206d4b0901
Documentation
Main documentation in English (4 pages, including figures, photos and references) "Methodology for phenotypic evaluation of RYMV isolates under controlled conditions"
Mar 23, 2023
Barro, Mariam; Sérémé, Drissa; Bangratz, Martine; Kassankogno, Itolou Abalo; Wonni, Issa; Poulicard, Nils; Tollenaere, Charlotte, 2023, "Yellow mottle disease epidemiology: RYMV specific detection in field-collected leaves from western Burkina Faso (2015-2019)", https://doi.org/10.23708/GZCM1O, DataSuds, V1, UNF:6:QdAkQ0xLZwp669pBgerjJg== [fileUNF]
This project aims at a better understanding of yellow mottle disease epidemiology, both at the regional level, by comparing irrigated areas to rainfed lowland rice, and at the within-field level. The study area is located in western Burkina Faso, in a 100x100kms region within the...
Tabular Data - 2.4 KB - 2 Variables, 16 Observations - UNF:6:IImh9MretzuHiTJt01JxqA==
Documentation
Data dictionary of the file Data_RYMV_BF_Fields_Dataset.tab
Tabular Data - 14.8 KB - 17 Variables, 203 Observations - UNF:6:oku1ggfNdVaSH8uTq3GZ4w==
Data
Field data
Adobe PDF - 588.0 KB - MD5: f804f7cd36b95cb15def95ad0596c811
Documentation
Dataset detailed documentation (9 pages, French and English): "General methodology and study sites", "Studied rice fields", "Symptom observation and sampling", ...
Tabular Data - 1.0 KB - 2 Variables, 8 Observations - UNF:6:stpYxexnk/bMEzGYlfUiBQ==
Documentation
Data dictionary of the file Data_RYMV_BF_Samples_Dataset.tab
Tabular Data - 77.3 KB - 9 Variables, 1317 Observations - UNF:6:sPlXi/4dgpiIJ4xOW7/omQ==
Data
Sample data
Nov 2, 2021
Barro, Mariam; Wonni, Issa; Tollenaere, Charlotte, 2021, "Soil Physicochemical Properties in rice fields from six sites in western Burkina Faso, 2018", https://doi.org/10.23708/LZ8A5B, DataSuds, V1, UNF:6:rqze4JhkLprhV3rphRgnmg== [fileUNF]
This dataset presents the physico-chemical analysis of 19 soil samples, from 6 rice-growing sites in western Burkina Faso (Hauts-Bassins and Cascades). The six sites are located in the 3 geographical zones, all in Lixisols (soils with subsurface accumulation of low activity clays...
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