UMR MIVEGEC

Infectious Diseases and Vectors: Ecology, Genetics, Evolution and Control

The aims of the group MIVEGEC are to develop integrative and transdisciplinary research to the mechanisms that maintain, amplify and transmit pathogenic agents, along with their genetic and epigenetic determinants, in order to better understand how these systems evolve and to improve their control.

L’UMR MIVEGEC "Maladies Infectieuses et Vecteurs : Ecologie, Génétique, Evolution et Contrôle" a pour mission de comprendre, via des recherches intégratives et transdisciplinaires, les mécanismes de maintenance, d’amplification et de transmission d’agents pathogènes, leurs déterminants génétiques et non génétiques, afin de pouvoir mieux appréhender l’évolution de ces systèmes infectieux et contribuer à en améliorer le contrôle.

Porpoises genetics and genomics

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61 to 70 of 274 Results

virus_genome_to_id.tab Mar 4, 2026 - Replication Data and Scripts : ViroSeek a viral detection pipeline for second-generation sequencing Tabular Data - 202 B - 2 Variables, 3 Observations - UNF:6:u5bQZ+jVWrdnqQ55z0s0Ug== Données Companion file for CAMISIM_script.sh (tsv version)
virus_metadata.tab Mar 4, 2026 - Replication Data and Scripts : ViroSeek a viral detection pipeline for second-generation sequencing Tabular Data - 242 B - 4 Variables, 4 Observations - UNF:6:zhJIrFmnz3PZU69+GdDv1w== Données Companion file for CAMISIM_script.sh (tsv version)
virus_mini_config.ini Mar 4, 2026 - Replication Data and Scripts : ViroSeek a viral detection pipeline for second-generation sequencing Unknown - 1.0 KB - MD5: e9e88231f8769d4d40be1d77a9dbb801 Code Companion file for CAMISIM_script.sh
Virustaxo.sh Mar 4, 2026 - Replication Data and Scripts : ViroSeek a viral detection pipeline for second-generation sequencing Shell Script - 796 B - MD5: 0795e28824f2eea8ac17a2831eff3fa2 Code Virustaxo command script.
OMEES__atelierParticipatifMoustiqueTigre_Deroule.pdf Feb 23, 2026 - Résultats d’un atelier participatif de co-construction d’un système de surveillance et d’alerte précoce pour le moustique tigre (Aedes albopictus) en Occitanie Adobe PDF - 1.3 MB - MD5: 913a49719eaf5615dfbe3d3e34940499 Données Document méthodologique décrivant le contexte, les objectifs, les profils de participants, le déroulé et les outils d’animation de l’atelier
OMEES__atelierParticipatifMoustiqueTigre_Donnees.pdf Feb 23, 2026 - Résultats d’un atelier participatif de co-construction d’un système de surveillance et d’alerte précoce pour le moustique tigre (Aedes albopictus) en Occitanie Adobe PDF - 12.6 MB - MD5: 28209c60853dbccfea14f4bf546d8bca Données Présentation des données produites par les différents organismes/instituts participant à l'atelier
OMEES__atelierParticipatifMoustiqueTigre_Fiches.zip Feb 23, 2026 - Résultats d’un atelier participatif de co-construction d’un système de surveillance et d’alerte précoce pour le moustique tigre (Aedes albopictus) en Occitanie ZIP Archive - 204.7 KB - MD5: 4922eb80075797f33e8b8c50e39b52fa Données Fiches mobilisées pendant l'atelier pour les différentes activités
OMEES__atelierParticipatifMoustiqueTigre_Livrables.zip Feb 23, 2026 - Résultats d’un atelier participatif de co-construction d’un système de surveillance et d’alerte précoce pour le moustique tigre (Aedes albopictus) en Occitanie ZIP Archive - 69.6 MB - MD5: 726c22097a382eb4feedba1483f46077 Données Synthèse des résultats de l’atelier, incluant les profils d’utilisateurs cibles, l’expression des besoins, les scénarios d’usage envisagés, les indicateurs prioritaires et les enjeux associés à la surveillance et à l’alerte précoce du moustique tigre
OMEES__atelierParticipatifMoustiqueTigre_Programme.pdf Feb 23, 2026 - Résultats d’un atelier participatif de co-construction d’un système de surveillance et d’alerte précoce pour le moustique tigre (Aedes albopictus) en Occitanie Adobe PDF - 184.4 KB - MD5: 7e53f60affb9546e7c70a0ab92d4175e Données Tableau synthétique présentant le programme de l'atelier
ReadMe_10-23708-2RXQC6.txt Feb 23, 2026 - Résultats d’un atelier participatif de co-construction d’un système de surveillance et d’alerte précoce pour le moustique tigre (Aedes albopictus) en Occitanie Plain Text - 2.2 KB - MD5: e6f5abc696ebb9cf2fc207a167406e8e Documentation contains the citation, description and conditions of use, or even access, depending on the case, to the dataset

virus_genome_to_id.tab

Mar 4, 2026 - Replication Data and Scripts : ViroSeek a viral detection pipeline for second-generation sequencing

Tabular Data - 202 B - 2 Variables, 3 Observations -

Données

Companion file for CAMISIM_script.sh (tsv version)

virus_metadata.tab

Mar 4, 2026 - Replication Data and Scripts : ViroSeek a viral detection pipeline for second-generation sequencing

Tabular Data - 242 B - 4 Variables, 4 Observations -

Données

Companion file for CAMISIM_script.sh (tsv version)

virus_mini_config.ini

Mar 4, 2026 - Replication Data and Scripts : ViroSeek a viral detection pipeline for second-generation sequencing

Unknown - 1.0 KB -

Code

Companion file for CAMISIM_script.sh

Virustaxo.sh

Mar 4, 2026 - Replication Data and Scripts : ViroSeek a viral detection pipeline for second-generation sequencing

Shell Script - 796 B -

Code

Virustaxo command script.

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Feb 23, 2026 - Résultats d’un atelier participatif de co-construction d’un système de surveillance et d’alerte précoce pour le moustique tigre (Aedes albopictus) en Occitanie

Adobe PDF - 1.3 MB -

Données

Document méthodologique décrivant le contexte, les objectifs, les profils de participants, le déroulé et les outils d’animation de l’atelier

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Feb 23, 2026 - Résultats d’un atelier participatif de co-construction d’un système de surveillance et d’alerte précoce pour le moustique tigre (Aedes albopictus) en Occitanie

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Données

Présentation des données produites par les différents organismes/instituts participant à l'atelier

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Données

Fiches mobilisées pendant l'atelier pour les différentes activités

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Feb 23, 2026 - Résultats d’un atelier participatif de co-construction d’un système de surveillance et d’alerte précoce pour le moustique tigre (Aedes albopictus) en Occitanie

ZIP Archive - 69.6 MB -

Données

Synthèse des résultats de l’atelier, incluant les profils d’utilisateurs cibles, l’expression des besoins, les scénarios d’usage envisagés, les indicateurs prioritaires et les enjeux associés à la surveillance et à l’alerte précoce du moustique tigre

OMEES__atelierParticipatifMoustiqueTigre_Programme.pdf

Feb 23, 2026 - Résultats d’un atelier participatif de co-construction d’un système de surveillance et d’alerte précoce pour le moustique tigre (Aedes albopictus) en Occitanie

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Données

Tableau synthétique présentant le programme de l'atelier

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Feb 23, 2026 - Résultats d’un atelier participatif de co-construction d’un système de surveillance et d’alerte précoce pour le moustique tigre (Aedes albopictus) en Occitanie

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