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2_Tursiops_unlinkedSNPs.beagle.gz
Sep 2, 2021 - Replication Data for: Selection on ancestral genetic variation fuels repeated ecotype formation in bottlenose dolphins
Gzip Archive - 85.1 MB - MD5: 8fe3f103955bdd7dd145c316dc008fe6
Data
Genotype likelihood LD pruned input file in Beagle format. Note that Sample order (Ind0 to Ind55) is given in the file Tursiops_samples_no7Tt182.bamlist. Sample 7Tt182 is not included in the beagle file due to its low coverage but clusters with the other NWAp. See materials and...
3_Tursiops_ALL.haplo.gz
Sep 2, 2021 - Replication Data for: Selection on ancestral genetic variation fuels repeated ecotype formation in bottlenose dolphins
Gzip Archive - 108.0 MB - MD5: e7909efb3649e2ac35f3cb17268be917
Data
haplo file (pseudo-haploid random call): samples order is given in Tursiops_samples_ALL.bamlist. Note that 7Tt182 is included, but was not included in the analyses, which are based on subset of individuals (one coastal individual and all allopatric pelagic individuals except from...
4_GhostAncestry-master.tar.gz
Sep 2, 2021 - Replication Data for: Selection on ancestral genetic variation fuels repeated ecotype formation in bottlenose dolphins
Gzip Archive - 8.8 KB - MD5: d5234dbb967ad08679ed0eb346e3308e
Code
GhostAncestry-master contains the codes written by Benoit Simon-Bouhet to generate the input files for the ghost ancestry analyses - also available at https://github.com/besibo/GhostAncestry ## The folder 1_One Scaffold contains the code to test the script on one scaffold only #...
Tursiop_samples_ALL.bamlist.txt
Sep 2, 2021 - Replication Data for: Selection on ancestral genetic variation fuels repeated ecotype formation in bottlenose dolphins
Unknown - 351 B - MD5: 8b7e2ce3192a5f460626c00d41c18f65
Data
Names of the samples and their order. See materials and methods and supplementary material for details on data generation
Tursiop_samples_no7Tt182.bamlist.txt
Sep 2, 2021 - Replication Data for: Selection on ancestral genetic variation fuels repeated ecotype formation in bottlenose dolphins
Unknown - 344 B - MD5: 734cebd2c7212d5a5b48cead8ebd0d42
Data
Names of the samples and their order, after excluding sample 7Tt182. See materials and methods and supplementary material for details on data generation
Paysages vivants du versant Ouest de l'île de La Réunion, entre littoral urbanisé et forêt d'altitude
Paysages vivants du versant Ouest de l'île de La Réunion, entre littoral urbanisé et forêt d'altitude
Jul 21, 2021 - UMR ESPACE-DEV
Loireau, Maud; Fargette, Mireille; DAVID, Gilbert, 2021, "Paysages vivants du versant Ouest de l'île de La Réunion, entre littoral urbanisé et forêt d'altitude", https://doi.org/10.23708/RGHHLQ, DataSuds, V1
Ce jeu de données est constitué de neuf fiches descriptives de paysages et leur cartographie. Il s’appuie sur des campagnes d’observations paysagères de terrain entre 2012 et 2016 sur un cas d’étude du versant Ouest de l'île de La Réunion (partie Sud de la commune de Saint Paul,...
PVR_00_D1-metadonnees.pdf
PVR_00_D1-metadonnees.pdf
Jul 21, 2021 - Paysages vivants du versant Ouest de l'île de La Réunion, entre littoral urbanisé et forêt d'altitude
Adobe PDF - 5.8 MB - MD5: 7a65c2083ab7afac1b152c8277dd2fed
Documentation
Description du jeu de données et de l'ensemble des documents.
PVR_01_P-synthese.pdf
PVR_01_P-synthese.pdf
Jul 21, 2021 - Paysages vivants du versant Ouest de l'île de La Réunion, entre littoral urbanisé et forêt d'altitude
Adobe PDF - 8.0 MB - MD5: 53f0f6e8f8c7f9dedd0efa6d6fa3683f
Documentation
Synthèse paysagère : cartographie des paysages de la zone d’étude.
PVR_02_D2-fiche-observation-terrain.pdf
PVR_02_D2-fiche-observation-terrain.pdf
Jul 21, 2021 - Paysages vivants du versant Ouest de l'île de La Réunion, entre littoral urbanisé et forêt d'altitude
Adobe PDF - 157.1 KB - MD5: d745c2379d66fb87b61cb07d97b6fb24
Fiches vierges d’observation paysagère
PVR_03_D3-formation-vegetale.pdf
PVR_03_D3-formation-vegetale.pdf
Jul 21, 2021 - Paysages vivants du versant Ouest de l'île de La Réunion, entre littoral urbanisé et forêt d'altitude
Adobe PDF - 91.8 KB - MD5: dd74c157cab74e1977c9be5833afd66f
Liste des principales formations végétales spontanées des paysages de bas de versants (voir P1, P2 et P3) décrites selon 4 critères observés : pourcentage de recouvrement, espèces ligneuses dominantes, espèces végétales remarquables, pourcentage de sol nu.
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